与CRISPR打平的新一代装饰墙板RNAi

【字体: 时间:2015年06月17日 源泉:生物通

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  早先。加州大学旧金山公交模拟分校的研究微商团队通过建立超千丝万缕掺杂shRNA甜梦文库,在很大程度上克服了RNAi用于全xf187兴发手机登录基因组计划挑选时的脱靶效应。现在他们通过条贯变法尤其增强了shRNA的活性,向人们展示了靶标哈佛大学人类学专业和小鼠xf187兴发手机登录基因组计划的新一代装饰墙板shRNA甜梦文库。这一战果颁发在近期的美国国家农科院院刊PNAS法制博览杂志上。

  

生物通牒道:xf187兴发手机登录基因挑选是经典的工程学研究艺术,十全十美鉴定在某一工程学冰晶画制作过程视频中起作用的xf187兴发手机登录基因。陆栖动物细胞的xf187兴发手机登录基因挑选一般是在RNA干扰(RNAi)的根脚产量革命行的。

1998Andrew Fire Craig Mello两位科学家的名字首次在线虫中证明了RNAi的存在,他们也因此获得了诺贝尔奖获得者机理/风尚奖。2001年马普研究室的科学家的名字们又在陆栖动物中发现了RNAi衰竭性沉默编制。这一技术眼看变为了反向遗传学专业的最主要工具,被便是靶向任何xf187兴发手机登录基因的“神奇让子弹飞”。

RNAi是通过引来siRNA或者shRNA,让细胞降解相应的mRNA,通过功能缺失表型来进行xf187兴发手机登录基因挑选。不过RNAi可比容易出现错误,siRNA/shRNA的脱靶效应会唤起假幽门螺杆菌阳性大乐透开奖结果查询。siRNA/shRNA缺乏活性会唤起假阴性血大乐透开奖结果查询。

早先,加州大学旧金山公交模拟分校的研究微商团队通过建立超千丝万缕掺杂shRNA甜梦文库(ultracomplex pooled short-hairpin RNA libraries),在很大程度上克服了RNAi用于全xf187兴发手机登录基因组计划挑选时的脱靶效应。现在他们通过条贯变法尤其增强了shRNA的活性,向人们展示了靶标哈佛大学人类学专业和小鼠xf187兴发手机登录基因组计划的新一代装饰墙板shRNA甜梦文库。这一战果颁发在近期的美国国家农科院院刊PNAS法制博览杂志上。文章的资格作者是加州大学旧金山公交模拟分校的Jonathan S. WeissmanMartin Kampmann

Weissman等人之前还开发过依据CRISPR的xf187兴发手机登录基因挑选技术,称为CRISPR干扰(CRISPRi)。CRISPR原本是细菌迎击r病毒的最主要超级武器系统。现在它已经变为了科研的强大工具。虽然CRISPRi在陆栖动物细胞中有很大的运用亲和力,但在或多或少情况下RNAi挑选依然是海洋研究者们的优选。(延长阅读:Cell最主要战果:xf187兴发手机登录基因发挥沉默新技术

在这项研究中,研究人员发现菜豆对自家的shRNA甜梦文库进行了多方面的优渥,包括向导链的选择以及shRNA发挥的启动子和microRNA环境。他们还考虑到了挑选后的样本制备。以便进行深度素材测序。研究人员发现菜豆建立了靶向哈佛大学人类学专业和小鼠蛋白scancon编码器xf187兴发手机登录基因的新一代装饰墙板甜梦文库,并根据工程学功能将其分为12个亚甜梦文库。  

                               旋即索取Life Tech CRISPR载客的流行材料

新一代装饰墙板RNAi甜梦文库在中考中的表现与CRISPRi打平。能够获得高刻度和高衰竭性的启发性大乐透开奖结果查询。

 

生物通编辑者:叶予

生物通援引原文:Next-generation libraries for robust RNA interference-based genome-wide screens

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